ฝ่ายสมเด็จพระมหาจักรพรรดิ เมื่อได้ทรงทราบเรื่อง จึงทำการยกทัพไปที่บริเวณโคกพญา โดยก่อนหน้านั้นมีพระภิกษุรูปนามว่ามหานาค ซึ่งจำพรรษาที่วัดภูเขาทอง ได้ทำการกออกมาเพื่อรวบรวมญาติโยมที่เคารพนับถือท่าน ช่วยกันตั้งค่ายขุดคูกันทัพเรือของข้าศึก ที่ยกทัพมาจากเมืองกาญจนบุรี ตั้งแต่วัดภูเขาทองจนถึงวัดป่าพลู ศึกครั้งนี้กรุงศรีอยุธยาได้สูญเสียสมเด็จพระสุริโยทัย และพระราชธิดาในที่รบ

เมื่อเดินทางมาถึง จะเห็นเพียงโคกดินสูง และเศษก้อนอิฐโบราณที่กระจายทั่วไป อีกทั้งได้พบกระเบื้องเชิงชายที่แตกหักจำนวนหนึ่ง รวมถึงเศษซากพระพุทธรูป และลูกนิมิตโบราณอีก 2 ลูก ที่ชาวบ้านได้ทำการสร้างศาลาเพื่อประดิษฐานองค์พระพุทธรูปที่ยังพอหลงเหลืออยู่ในปัจจุบัน